深度感知——以計(jì)算之力,點(diǎn)燃生命科學(xué)的新可能
摘要
在粵港澳大灣區(qū)蓬勃發(fā)展的創(chuàng)新熱土上,一位00后香港青年正帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)掀起AI制藥領(lǐng)域的變革浪潮。深度感知?jiǎng)?chuàng)始人劉天悅,憑借對(duì)交叉學(xué)科的深刻洞察,聯(lián)合計(jì)算機(jī)科學(xué)與藥學(xué)領(lǐng)域的青年精英,打造出國(guó)內(nèi)首個(gè)集“算法開發(fā)、分子模擬、協(xié)同研發(fā)”于一體的智能藥物設(shè)計(jì)平臺(tái)MediElixir。這支“青年團(tuán)隊(duì)”,以技術(shù)普惠為使命,將復(fù)雜的分子動(dòng)力學(xué)模擬(MD)與前沿AI模型深度融合,構(gòu)建起連接算法開發(fā)者與藥物研發(fā)者的橋梁,助力創(chuàng)新藥物研發(fā)駛?cè)搿爸悄芗铀佟毙潞降馈?
從左到右依次為 劉天悅 陳茂波 楊凌智 王騰楊
青年力量破局:當(dāng)計(jì)算機(jī)遇見藥學(xué)難題
2021年的某個(gè)深夜,暨南大學(xué)計(jì)算機(jī)專業(yè)的學(xué)生劉天悅與藥學(xué)專業(yè)的室友仍在實(shí)驗(yàn)室激烈討論。他們發(fā)現(xiàn),盡管AI算法在圖像識(shí)別、自然語(yǔ)言處理等領(lǐng)域大放異彩,但在藥物研發(fā)場(chǎng)景中,大量先進(jìn)技術(shù)卻因交叉學(xué)科人才斷層而“束之高閣”。“既然我們有能力開發(fā)算法,為什么不打造一個(gè)讓藥學(xué)家也能輕松使用AI的工具?”這個(gè)樸素的想法,成為深度感知生物醫(yī)學(xué)科技誕生的起點(diǎn)。
這支由90后、00后組成的年輕團(tuán)隊(duì),在創(chuàng)業(yè)初期便展現(xiàn)出驚人的技術(shù)韌性。面對(duì)分子動(dòng)力學(xué)模擬(MD)領(lǐng)域極高的學(xué)習(xí)門檻,他們耗時(shí)三年開發(fā)出國(guó)內(nèi)首個(gè)“可視化、可分享、可上傳的計(jì)算模擬系統(tǒng)”,將原本需要編寫數(shù)千行代碼的復(fù)雜模擬流程,轉(zhuǎn)化為拖拽式操作界面。更令人矚目的是,團(tuán)隊(duì)創(chuàng)新性地將VAE(變分自編碼器)與Transformer模型相結(jié)合,攻克多靶點(diǎn)分子生成的技術(shù)難題,使算法平臺(tái)在保持科研級(jí)精度的同時(shí),實(shí)現(xiàn)藥企研發(fā)成本的指數(shù)級(jí)下降。
MediElixir:讓算法成為藥物研發(fā)的“通用語(yǔ)言”
走進(jìn)深度感知的研發(fā)中心,屏幕上跳動(dòng)的分子結(jié)構(gòu)三維模型揭示著MediElixir系統(tǒng)的核心價(jià)值——這個(gè)集成了6000多個(gè)算法模塊的智能平臺(tái),正在重新定義藥物研發(fā)的工作范式。通過(guò)打通靶點(diǎn)預(yù)測(cè)、分子生成、可合成性質(zhì)分析等關(guān)鍵環(huán)節(jié),研究者只需在交互式界面輸入靶蛋白結(jié)構(gòu),系統(tǒng)即可自動(dòng)生成潛在候選分子,并預(yù)測(cè)其結(jié)合模式與成藥性參數(shù)。
平臺(tái)的突破性創(chuàng)新在于“雙生態(tài)”架構(gòu)設(shè)計(jì):一方面,它整合了康奈爾大學(xué)、清華大學(xué)、北京大學(xué)等32家頂尖機(jī)構(gòu)的開放算法庫(kù),形成覆蓋4000多名研究者的協(xié)同網(wǎng)絡(luò);另一方面,通過(guò)與百度飛槳等國(guó)產(chǎn)AI框架深度適配,將前沿計(jì)算能力轉(zhuǎn)化為藥企研發(fā)部門的“生產(chǎn)力工具”。某合作藥企的測(cè)試數(shù)據(jù)顯示,使用MediElixir系統(tǒng)后,先導(dǎo)化合物篩選周期從傳統(tǒng)方法的18個(gè)月壓縮至7個(gè)月,且候選分子進(jìn)入臨床前研究的通過(guò)率提升3倍。
“我們不僅在開發(fā)工具,更在構(gòu)建生物醫(yī)藥領(lǐng)域的‘開發(fā)者生態(tài)’。”劉天悅?cè)绱嗽忈屍脚_(tái)愿景。
灣區(qū)沃土育新苗:技術(shù)信仰照亮創(chuàng)業(yè)征途
在粵港澳大灣區(qū)國(guó)際科技創(chuàng)新中心的戰(zhàn)略布局下,深度感知的成長(zhǎng)軌跡恰是“灣區(qū)育才”機(jī)制的生動(dòng)寫照。團(tuán)隊(duì)多元背景構(gòu)成的“創(chuàng)新基因”,使他們?cè)诠タ思夹g(shù)難關(guān)時(shí)總能找到獨(dú)特路徑。
回憶起創(chuàng)業(yè)歷程,劉天悅坦言“每一步都如履薄冰”。在平臺(tái)架構(gòu)設(shè)計(jì)階段,團(tuán)隊(duì)曾連續(xù)7個(gè)月反復(fù)調(diào)整算法集成方案;在模型驗(yàn)證期,他們需要同步處理來(lái)自12個(gè)合作項(xiàng)目的海量數(shù)據(jù);甚至在測(cè)試產(chǎn)品上線前夕,還因用戶體驗(yàn)細(xì)節(jié)推翻重做了整個(gè)交互系統(tǒng)。“但正是大灣區(qū)完善的生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)鏈支撐著我們——這里有頂尖的實(shí)驗(yàn)室、資深的行業(yè)導(dǎo)師、以及敢為天下先的合作企業(yè)。”
如今,這支青年團(tuán)隊(duì)正將目光投向更遠(yuǎn)的技術(shù)疆界。他們與高校聯(lián)合開發(fā)的“AI制藥人才培養(yǎng)體系”,已累計(jì)為行業(yè)輸送多名復(fù)合型人才;而在底層算法層面,團(tuán)隊(duì)正在探索量子計(jì)算與生成式AI的融合應(yīng)用,試圖解鎖更復(fù)雜的蛋白-配體相互作用預(yù)測(cè)。
未來(lái)已來(lái):重新定義制藥的創(chuàng)新節(jié)奏
劉天悅常會(huì)望向珠江口繁忙的貨輪。這位年輕的創(chuàng)業(yè)者清楚,MediElixir平臺(tái)承載的不僅是技術(shù)理想,更代表著生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)換道超車的可能性。當(dāng)被問(wèn)及未來(lái)規(guī)劃時(shí),他的回答展現(xiàn)出一貫的務(wù)實(shí)與雄心:“我們將持續(xù)深耕三大方向——讓算法更精準(zhǔn)地理解生物系統(tǒng),讓平臺(tái)更廣泛地連接全球智慧,讓技術(shù)更深入地賦能實(shí)體研發(fā)。”
隨著平臺(tái)入駐研究人員數(shù)量以季度300%的速度增長(zhǎng),深度感知的故事正在書寫新的篇章。這或許印證著劉天悅常說(shuō)的那句話:“在灣區(qū)這片熱土上,青年創(chuàng)業(yè)者的天花板從來(lái)不是年齡,而是想象力的邊界。”
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